Всякий, кто, приняв католическую веру, позорно от нее отойдет или кто будет отказываться принимать ее, не должен пользоваться никакими указанными правами.
Для удостоверения этой грамоты привешена наша печать».
Как видно из приведенного текста, на православную знать привилегии польского короля Ягайло не распространялись. Тем самым католические феодалы противопоставлялись феодалам православным. Зимой 1387 года в Вильно прошел съезд знати Великого княжества Литовского, на который прибыли Ягайло-Владислав, Ядвига, некоторые польские магнаты и духовные иерархи Польши.
На съезде было принято решение начать крещение языческих земель ВКЛ по католическому обряду. Заметим, только языческих! Православные князья принудили тогда Ягайло сделать эту серьезную оговорку к тексту унии, но данный компромисс, как показало время, был лишь временной победой. С 1413 года по постановлению Городельского сейма устанавливалось, что экономическими привилегиями имеют право пользоваться только католики. Православные феодалы лишались права избрания великого князя. Браки между католиками и православными запрещались. Это был очень серьезный, а в долгосрочной перспективе даже смертельный удар по единству ВКЛ. Правда, и это решение позже было отменено, но процесс, что называется, пошел.
Карамзин отмечает, что Ягайло, сделавшись католиком, будучи прежде покровителем греческой веры, стал ее гонителем. Стеснял гражданские права православных, запретил брачные союзы между ними и католиками и даже казнил двух своих вельмож, не пожелавших принять новую веру в угоду королю. Подобные меры встретили сильный отпор среди русских и литовцев (принявших православие), они отказывались от католичества даже под угрозой казни. Этим новый король восстановил против себя немало подданных. Осуждали намерения Ягайло и язычники, у которых миссионеры уничтожили их священные рощи и изображения языческих богов. Скоро недовольство Ягайло стало всеобщим. На этом фоне не согласный с условиями Кревской унии Витовт возглавил борьбу за независимость Литвы.
К слову, в 1386 году начался новый этап усиления Москвы. Дмитрий Донской подписал договор с Олегом Рязанским и выдал свою дочь за его сына Фёдора. Были усилены позиции Москвы в Новгороде, и наметилось сближение с суздальским княжеским домом. Наступление католического элемента в ВКЛ обеспокоило и патриарха в Константинополе. Митрополит Киприан поспешил выступить с программой ликвидации польско-литовской унии и нового сближения Московской и Литовской Руси через брачный союз сына князя Дмитрия Донского Василия и дочери литовского князя Витовта Софьи, а также восстановления единства общерусской митрополии. В 1391 году Василий и Софья обвенчались. Константинопольский патриарх подготовил специальный документ, содержащий теоретическое обоснование программы Киприана, где также предусматривалась и замена митрополита Пимена митрополитом Киприаном. Это нашло отражение в известных литературных памятниках, созданных Киприаном: своде «Летописец великий русский» и «Слове о житии по преставлении великого князя Дмитрия Ивановича, царя русского». Тогда же был составлен список русских городов, дальних и ближних, очертивший древнерусскую территорию, включая Молдавию и часть Болгарии. Этот список обозначил распространение власти московского митрополита и в какой-то мере расшифровал программу создания общерусского государства, как ее мыслили сам Киприан, московский князь Василий (вступил на престол в 1389 году после смерти Дмитрия Ивановича) и Витовт (великий князь Литовский с 1392 года).
Здесь уместно напомнить, что с 1383 года Василий Дмитриевич являлся заложником Орды, и пребывание в ней не могло не сказаться на его формировании как личности. За освобождение Василия Орде был выплачен огромный выкуп, но Тохтамыш не отпускал его от себя. Наконец Василий бежал в ВКЛ (возможно, не случайно) и уже оттуда перебрался в Москву. Но политические взгляды Василия Дмитриевича, видимо, окончательно сформировались в Литве — под влиянием тесного общения с Витовтом и митрополитом Киприаном. В результате он стал практически единственным великим московским князем, который считал, что Владимирскому и Литовско-Русскому княжениям прежде всего надо решить задачу освобождения от Орды, а спор, кому из них быть объединительным центром русских земель, отнести на будущее.
Функции великого князя Литовского Ягайло выполнял через своего брата Скиргайло, который был православным и от своей веры не отступал. Возвышение Скиргайло до второго лица в государстве было с неодобрением воспринято Витовтом. Этим воспользовались силы, заинтересованные в возрождении междоусобицы, братьев старались поссорить. Прежде всего заметалась Орда. Тохтамыш сразу усилил Москву, выдав Василию I ярлык на Великое Владимирское княжение и передав под его руку Нижегородское княжество, Мещеру, города Городец и Таруса. Но следом, как бы испугавшись, он направил посольство в Вильню, целью которого было предотвратить наметившийся союз Москвы с Литвой. Большой логики здесь не просматривается, поскольку Тохтамыш в поисках поддержки на Руси своей борьбы с властелином Среднеазиатской Орды Тимуром (Тамерланом) реально сам и разрушал такую возможность. Но так произошло.
В Кракове Ягайло быстро донесли, что Витовт готовит измену против него и переписывается с Москвой, а Витовту, наоборот, стали говорить, что Скиргайло намеревается его уничтожить. Напряженность усиливалась и вот-вот готова была вылиться в братоубийственную войну. Стремясь предотвратить такое развитие ситуации, королева Ядвига в 1389 году устроила в Люблине встречу Витовта и Скиргайло. Витовт пообещал не слушать наветы и во всем помогать двоюродным братьям, но, вернувшись в Луцк, сразу приступил к подготовке выступления против них. Заговор не удался. Витовт бежал в Гродно и откуда организовал нападение на Вильню, но городские замки взять не сумел.